CIViC MCP: Integrating Large Language Models with the Clinical Interpretations of Variants in Cancer
本文介绍了 CIViC MCP 服务器,该工具通过大语言模型将自然语言查询与癌症变异临床解读知识库(CIViC)的 API 相结合,从而帮助用户快速汇总专家 curated 的癌症变异解读信息。
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本文介绍了 CIViC MCP 服务器,该工具通过大语言模型将自然语言查询与癌症变异临床解读知识库(CIViC)的 API 相结合,从而帮助用户快速汇总专家 curated 的癌症变异解读信息。
该研究揭示了 FILIP1L 作为关键调节因子,通过协调上皮 - 间质转化(EMT)进程中的细胞周期与伪足(invadopodia)活性,促进乳腺癌细胞的侵袭性迁移及转移。
该研究发现 HVEM 通过结合 APRIL 激活 NF-κB 信号通路促进间质型胶质母细胞瘤的生长与侵袭,而靶向 HVEM 的纳米抗体可通过阻断其与 APRIL 及 BTLA 的相互作用,有效抑制肿瘤进展并克服耐药性。
该研究利用时间 lapse 显微成像技术证实,靶向 NG2 抗原的嵌合抗原受体巨噬细胞(CAR-Ms)不仅能吞噬患者来源的胶质母细胞瘤细胞,还能在不改变其极化状态的情况下,有效阻断超过 85% 的肿瘤细胞三维侵袭行为。
该研究通过单核 RNA 测序和空间转录组技术,证实了 Keratin 阳性巨细胞富集肿瘤(KPGCT)中携带 HMGA2::NCOR2 融合基因的少数肿瘤细胞通过激活 Hippo 信号通路表达 CSF1,进而招募并诱导 CSF1R 阳性巨细胞及破骨细胞样巨细胞分化形成肿瘤主体,从而确立了 KPGCT 为独立于腱鞘巨细胞肿瘤(TGCT)的新实体,并为其应用 CSF1R 抑制剂治疗提供了理论依据。
该研究揭示了米托蒽醌通过抑制 AIF/CHCHD4 复合物诱导骨肉瘤细胞出现谷氨酰胺积累和核苷酸合成增加的代谢脆弱性,进而与谷氨酰胺酶抑制剂 telaglenastat 产生协同作用,为克服骨肉瘤化疗耐药提供了新的联合治疗策略。
该研究利用 SPEND-hSRS 显微成像技术,在活细胞中实现了高灵敏度、高分辨率的延胡索酸代谢成像,揭示了化疗压力下膀胱癌细胞线粒体代谢异质性及其与脂滴互作驱动癌细胞适应的机制。
该研究揭示了化疗药物长春新碱通过诱导多倍体巨癌细胞(PGCCs)进入一种替代有丝分裂的内复制生命周期,利用其衰老相关分泌表型(SASP)介导的炎症信号通路,驱动癌细胞获得耐药性并重建具有多胚层分化潜能的有序组织结构,从而阐明了肿瘤发生与早期胚胎发育在组织构建层面的共同机制。
该研究通过对比不同培养时长,发现胰腺癌成熟肿瘤球(长期 3D 培养)能更准确地模拟临床药物反应并揭示耐药机制,从而提出将成熟肿瘤球筛选纳入临床前工作流程以提升药物研发转化价值的框架。
该研究通过单细胞测序和基因调控网络分析,鉴定出胰腺癌中表达 NFATC2 的癌症相关成纤维细胞亚群具有肿瘤抑制特性,能增强化疗敏感性并与 ERBB 靶向疗法产生协同作用,从而预测治疗反应并优化联合治疗方案。
该研究通过整合多种测序技术绘制了多发性骨髓瘤的 RNA 修饰图谱,发现甲基转移酶 METTL3 通过 m6A 修饰调控长非编码 RNA NEAT1,进而影响多发性骨髓瘤细胞的存活。
该研究通过整合多组学数据与计算预测,系统描绘了恶性周围神经鞘瘤(MPNST)的抗原图谱,发现其新抗原具有高度个体化特征,且 PRC2 缺失亚型因免疫抑制微环境而更依赖染色体 8 驱动的表面肿瘤相关抗原(TAA),从而为基于 PRC2 状态的个性化免疫治疗策略提供了理论依据。
该研究揭示乳腺癌细胞与破骨细胞通过动态的非经典细胞融合及胞内吞噬(CIC)过程形成具有破骨细胞特征的杂交细胞,从而促进乳腺癌的骨转移。
该研究利用空间转录组学揭示了非小细胞肺癌在术前新辅助放化疗后,未达主要病理缓解(non-MPR)的残留肿瘤核心通过构建物理免疫排斥屏障、代谢重编程及维持 DNA 损伤修复能力形成耐药微环境,而达到缓解(MPR)的肿瘤则呈现免疫浸润特征,从而为克服耐药机制提供了新的空间生物学依据。
该研究鉴定出细胞周期蛋白 G 相关激酶(GAK)是弥漫大 B 细胞淋巴瘤(DLBCL)中一种受 RB1 缺失驱动的新型有丝分裂激酶靶点,并表明通过药物重定位利用现有强效抑制剂(如 OTS167)可迅速将其转化为临床治疗策略。
该研究通过时间序列转录组分析揭示,藏红花素(crocin)通过抑制剪接体机器、诱导细胞衰老及代谢重编程等机制,有效抑制肝细胞癌(HCC)细胞的增殖并逆转致癌通路。
该研究揭示了口腔鳞状细胞癌对 Src 抑制剂存在异质性敏感反应,并证实 Src 抑制剂与顺铂联合治疗不仅能通过抑制 Src 及 MAPK 通路有效抑制肿瘤生长,还能在保持疗效的同时将顺铂剂量减半,从而为降低化疗毒性提供了新的联合治疗策略。
该研究发现,在营养匮乏环境下,胰腺癌中致癌 RAS 突变通过激活 RAS/MAPK 通路诱导α2 整合素表达,进而促进细胞摄取细胞外基质、增强迁移能力并导致不良预后。
该研究开发了一种基于同一患者原发胶质母细胞瘤的“耐药干细胞家族”体外模型,通过分离化疗和放疗诱导的选择压力,揭示了治疗驱动下肿瘤干细胞在 DNA 损伤修复、细胞周期及受体酪氨酸激酶活性等方面的适应性重塑机制,为解析胶质母细胞瘤复发耐药性提供了新的研究平台。
该研究开发了一种利用微生物转谷氨酰胺酶实现定点偶联、具有均一性的 KIM-1 靶向抗体偶联药物(LT-025),其在肾细胞癌模型中表现出良好的稳定性与细胞毒性,且与舒尼替尼联用可产生协同抗肿瘤效应,为晚期肾癌治疗提供了新的策略。